某(mǒu)日，小新（矢(shǐ)岛(dǎo)晶(jīng)子(zǐ) 配音）、小葵(kuí)和(hé)美伢(yá)（楢(yóu)桥(qiáo)美纪(jì) 配音）被(bèi)一群神秘人物(wù)绑(bǎng)架，醒(xǐng)来之后发现身(shēn)处一间神秘的基(jī)地之内(nèi)，原(yuán)来，这(zhè)里(lǐ)是名(míng)为“温泉G组”的秘密(mì)组织，意(yì)在保(bǎo)护(hù)对(duì)于日本来说十(shí)分(fēn)珍(zhēn)贵(guì)的温泉然(rán)而，横(héng)空(kōng)出(chū)世的污垢达人博士（家弓(gōng)家正 配音）企(qǐ)图(tú)利(lì)用“地球(qiú)温泉计(jì)划(huà)”将(jiāng)温泉G组彻(chè)底击垮(kuǎ)。　　唯(wéi)一能够(gòu)阻(zǔ)止(zhǐ)污垢达人博士的阴谋的，就(jiù)只(zhǐ)有仅(jǐn)存(cún)在于传(chuán)说之中的“黄金之魂温泉”，而组员(yuán)们经过(guò)调查(chá)，发现该(gāi)温泉正好(hǎo)处于小新他们家地下(xià)。小新一家人决(jué)定(dìng)帮(bāng)助(zhù)温泉G组的同(tóng)胞(bāo)们找到黄金之魂温泉，却(què)遭到了污垢达人博士的袭(xí)击，并(bìng)且(qiě)最(zuì)终(zhōng)沦(lún)为俘虏(lǔ)遭受(shòu)了酷(kù)刑(xíng)。